方谷駅舎は、木造平屋建て、切妻造セメント瓦葺の屋根の駅舎で、1928(昭和3)年の駅開業にあわせて建設されました。南面の東寄りには車寄を設け、出入口としています。車寄では柱を洗い出しという技法で凝った意匠にするなど、ほかの駅舎には見られない特徴もあります。

建設当初の様相を非常によく残していることから、「国土の歴史的景観に寄与している」という登録有形文化財の基準を満たしていると評価され、2011(平成23)年3月18日に、登録有形文化財(建造物)になりました。

駅名は、当地出身(岡山県高梁市)の幕末の漢学者、山田方谷(やまだ ほうこく)に由来。駅名に人名が使われた最初の例と言われています。